外用莫匹罗星、瑞他莫林、夫西地酸或ozenoxacin。
有时需口服抗生素
受累区每日多次使用肥皂水清洗，去除所有痂皮。
局限性脓疱病外用莫匹罗星软膏，每日3次，持续7天，瑞他莫林软膏每日2次，持续5天，或1%奥泽诺沙星霜每12小时使用，连续使用5天。美国没有2%富西地酸乳膏
免疫功能低下、有广泛或耐药性脓疱病病变或有淤血的患者可能需要口服抗生素（例如，双氯西林或头孢氨苄250至500 mg，每天4次【12.5 mg/kg，儿童每天4次】，持续10天）。对于青霉素过敏的患者，可以使用300 毫克克林霉素，每6小时一次，或250 毫克红霉素，每6小时一次，但这两种抗生素的耐药性问题日益严重。
除非有强有力的证据支持（如具有与确诊MRSA感染者接触史、明确的暴发流行的接触史；所在区域MRSA培养阳性率>10~15%），一般不推荐初始即进行抗MRSA治疗。MRSA的治疗需要在培养和药敏结果的指导下进行。克林霉素、磺胺甲噁唑/甲氧苄啶和多西环素对大多数社区获得性MRSA是有效的。
其他治疗包括对患有特应性皮炎和广泛干燥症 的患者使用润肤剂，来维持正常的皮肤屏障 功能，必要时使用糖皮质激素。慢性鼻葡萄球菌携带者可局部使用抗生素（莫匹罗星）1周；然而，数据并没有明确表明这种非殖民化会降低脓疱病的复发率。
及时治疗常可迅速缓解。延误治疗可导致蜂窝织炎、淋巴管炎、疖病及皮肤色素沉着或减退，伴有或不伴有瘢痕形成。2～4岁儿童若感染致肾病性A群链球菌（49型、55型、57型、59型），有发生急性肾小球肾炎的风险；美国南部肾炎发生率高于其他地区。抗生素治疗并不能预防链球菌感染后肾小球肾炎。